A APAE Consultoria é uma unidade responsável pelo repasse e pela aplicação do conhecimento gerado e acumulado no Instituto de Ensino e Pesquisa Darci Barbosa (IEP-MG), para a Rede Mineira das Apaes. Além disso, auxilia as instituições e outras organizações da sociedade civil a desenvolverem projetos nas áreas de saúde, trabalho, educação e assistência social voltadas para a pessoa com deficiência intelectual e múltipla, bem como na gestão de organizações do 3º setor. Esta unidade oferta apoio à Rede das Apaes por meio de duas propostas: a consultoria e assessoria além do SIGA.
Consultoria é o atendimento às Apaes a partir de solicitação feita por meio de ofício assinado pelo presidente da Apae, com o objetivo de realizar um diagnóstico institucional seguido de acompanhamento técnico aprofundado para estruturação ou aprimoramento nas áreas de saúde, assistência social, educação e gestão. Já a Assessoria é o atendimento às Apaes por meio dos canais de comunicação (e-mail, telefone), com o objetivo de orientar sobre demandas técnicas pontuais, que não exijam maior aprofundamento técnico.